Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rb1cc1Q9ESK9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rb1cc1Q9ESK9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms