Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ube3bQ9ES34 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ube3bQ9ES34 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ube3bQ9ES34 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ube3bQ9ES34 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ube3bQ9ES34 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ube3bQ9ES34 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ube3bQ9ES34 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms