Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfcp2Q9ERA0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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