Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER74

Sall1, Sal-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall1Q9ER74 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall1Q9ER74 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms