Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Tspan4Q9DCK3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Tspan4Q9DCK3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Tspan4Q9DCK3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Tspan4Q9DCK3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Tspan4Q9DCK3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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