Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MNCb-2875Q9DCB3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MNCb-2875Q9DCB3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MNCb-2875Q9DCB3 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MNCb-2875Q9DCB3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MNCb-2875Q9DCB3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MNCb-2875Q9DCB3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MNCb-2875Q9DCB3 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MNCb-2875Q9DCB3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MNCb-2875Q9DCB3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MNCb-2875Q9DCB3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MNCb-2875Q9DCB3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MNCb-2875Q9DCB3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MNCb-2875Q9DCB3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MNCb-2875Q9DCB3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MNCb-2875Q9DCB3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MNCb-2875Q9DCB3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MNCb-2875Q9DCB3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MNCb-2875Q9DCB3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
MNCb-2875Q9DCB3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
MNCb-2875Q9DCB3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MNCb-2875Q9DCB3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MNCb-2875Q9DCB3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MNCb-2875Q9DCB3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MNCb-2875Q9DCB3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MNCb-2875Q9DCB3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MNCb-2875Q9DCB3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MNCb-2875Q9DCB3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
MNCb-2875Q9DCB3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
MNCb-2875Q9DCB3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MNCb-2875Q9DCB3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms