Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm8048-201ENSMUST00000182555 996 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Olfr1163-202ENSMUST00000215268 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm24925-201ENSMUST00000178157 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm44156-201ENSMUST00000203885 1189 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 BC060293-201ENSMUST00000207005 1104 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Olfr204-201ENSMUST00000072517 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok3Q9DBU3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms