Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SrpraQ9DBG7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms