Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ccdc89Q9DA73 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ccdc89Q9DA73 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc89Q9DA73 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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