Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8N1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8N1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8N1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8N1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8N1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8N1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8N1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8N1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8N1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8N1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D8N1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms