Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Echdc3Q9D7J9 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms