Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Capns2Q9D7J7 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Capns2Q9D7J7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Capns2Q9D7J7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Capns2Q9D7J7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Capns2Q9D7J7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Capns2Q9D7J7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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