Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms