Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn23Q9D7D7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms