Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pfn4Q9D6I3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pfn4Q9D6I3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms