Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc7Q9D541 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms