Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gpn3Q9D3W4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms