Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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