Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms