Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Q9D2Q3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms