Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pramef12Q9D2F1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pramef12Q9D2F1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms