Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Susd3Q9D176 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Susd3Q9D176 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Susd3Q9D176 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Susd3Q9D176 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Susd3Q9D176 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Susd3Q9D176 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Susd3Q9D176 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Susd3Q9D176 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Susd3Q9D176 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Susd3Q9D176 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Susd3Q9D176 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Susd3Q9D176 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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