Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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