Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mis12Q9CY25 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms