Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rpl11Q9CXW4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms