Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Xrcc3Q9CXE6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Xrcc3Q9CXE6 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Xrcc3Q9CXE6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Xrcc3Q9CXE6 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Xrcc3Q9CXE6 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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