Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snw1Q9CSN1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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