Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
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