Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms