Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl11Q9CQF0 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms