Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Chchd1Q9CQA6 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Chchd1Q9CQA6 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Chchd1Q9CQA6 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Chchd1Q9CQA6 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Chchd1Q9CQA6 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Chchd1Q9CQA6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Chchd1Q9CQA6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Chchd1Q9CQA6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Chchd1Q9CQA6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Chchd1Q9CQA6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Chchd1Q9CQA6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Chchd1Q9CQA6 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Chchd1Q9CQA6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Chchd1Q9CQA6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Chchd1Q9CQA6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms