Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Use1Q9CQ56 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Use1Q9CQ56 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Use1Q9CQ56 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Use1Q9CQ56 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Use1Q9CQ56 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Use1Q9CQ56 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Use1Q9CQ56 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Use1Q9CQ56 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Use1Q9CQ56 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Use1Q9CQ56 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Use1Q9CQ56 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Use1Q9CQ56 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Use1Q9CQ56 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Use1Q9CQ56 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Use1Q9CQ56 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Use1Q9CQ56 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Use1Q9CQ56 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Use1Q9CQ56 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Use1Q9CQ56 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Use1Q9CQ56 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Use1Q9CQ56 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Use1Q9CQ56 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Use1Q9CQ56 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Use1Q9CQ56 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Use1Q9CQ56 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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