Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl17Q9CPR4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl17Q9CPR4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms