Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Smim3Q99PE5 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms