Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nup155Q99P88 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nup155Q99P88 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nup155Q99P88 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nup155Q99P88 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nup155Q99P88 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup155Q99P88 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup155Q99P88 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup155Q99P88 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup155Q99P88 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup155Q99P88 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup155Q99P88 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup155Q99P88 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup155Q99P88 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup155Q99P88 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup155Q99P88 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup155Q99P88 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup155Q99P88 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup155Q99P88 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup155Q99P88 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup155Q99P88 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup155Q99P88 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup155Q99P88 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup155Q99P88 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup155Q99P88 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup155Q99P88 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup155Q99P88 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup155Q99P88 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup155Q99P88 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup155Q99P88 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup155Q99P88 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup155Q99P88 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms