Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms