Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp16Q99LG0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms