Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ciao1Q99KN2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms