Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rab28Q99KL7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rab28Q99KL7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab28Q99KL7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rab28Q99KL7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Rab28Q99KL7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rab28Q99KL7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rab28Q99KL7 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rab28Q99KL7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab28Q99KL7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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