Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn2aQ99KJ0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms