Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Hps4Q99KG7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Hps4Q99KG7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms