Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Pacsin3Q99JB8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Pacsin3Q99JB8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pacsin3Q99JB8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms