Protein–RNA interactions for Protein: Q99J45

Nrbp1, Nuclear receptor-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrbp1Q99J45 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrbp1Q99J45 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms