Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms