Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms