Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Cacna1c-204ENSMUST00000112793 6669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Cemip-201ENSMUST00000064174 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Olfr943-204ENSMUST00000213830 8305 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Olfr943-205ENSMUST00000215770 8308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms