Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klc3Q91W40 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms