Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hps3Q91VB4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hps3Q91VB4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps3Q91VB4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps3Q91VB4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps3Q91VB4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hps3Q91VB4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hps3Q91VB4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps3Q91VB4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hps3Q91VB4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hps3Q91VB4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps3Q91VB4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps3Q91VB4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hps3Q91VB4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps3Q91VB4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps3Q91VB4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms