Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dkk4Q8VEJ3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms