Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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